菏泽的前身是创建于1949年的冀鲁豫区第二师范学校,历史上曾更名为平原省立菏泽师范学校、山东省菏泽*师范学校、菏泽师范专科学校。2002年,菏泽师范专科学校、菏泽教育、菏泽广播电视*3所学校合并,同时并入菏泽师范学校、菏泽农业学校,筹建菏泽。2004年,教育部正式批准更名为菏泽。2011年,单县幼儿师范学校、郓城幼儿师范学校并入菏泽。2017年,学校成为省级硕士培育建设单位。

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截至2024年12月,学校建有4个校区,总占地面积1424亩,建筑面积63万余平方米,教*研仪器设备总值2.3亿元;设有21个教学单位,开设66个本科专业;有在职教职工1704人,其中专任教师1266人;全日制本专科在校生2.46万人。